Операції на рахунках в банку підлягають суцільній перевірці. Джерелами даних для аудиту операцій на рахунках у банках є виписки банку з поточних рахунків і прикладені до них виправдувальні документи, а також записи в облікових регістрах за рахунком 31 "Рахунки в банках".
Перш за все, треба звірити залишки коштів, відображених у виписках за відповідними рахунками, із залишками коштів, які значаться за обліковими даними. Однак рівність залишків не гарантує тотожності оборотів за виписками банку і за балансовим рахунком, оскільки при обробці виписок може бути допущено навмисне зменшення оборотів за дебетом і кредитом рахунка на однакову суму з метою приховати зловживання. Тому слід перевірити відповідність оборотів за дебетом і кредитом рахунка за виписками банку за кожний місяць і даними оборотів за обліковими реєстрами. Важливо також перевірити повноту і достовірність банківських виписок і прикладених до них документів. Повноту банківських виписок встановлюють за їх нумерації по сторінках і перенесенням залишку коштів на рахунку. Залишок коштів на кінець періоду в попередній виписці банку за рахунком може дорівнювати залишку коштів на початок періоду в наступній виписці. Правильність виписки визначають шляхом перевірки всіх її реквізитів. Якщо у виписці буде встановлено необумовлені виправлення або підчищення, закреслення, то необхідно провести зустрічну перевірку даних виписки із записами в першому примірнику особового рахунка, який знаходиться в установі банку. У разі відсутності окремих виписок слід також звернутися до установи банку.
Крім того, слід переконатися, що всі здійснені через банк операції є реальними і підтверджені відповідними документами. Бувають випадки підробок документів, відсутності деяких примірників документів, що дає можливість, застосовуючи неправильну кореспонденцію рахунків, приховувати в обліку зловживання на значні суми. У разі виникнення сумнівів у достовірності документів (відсутність банківського штампа, виправлення сум, найменування одержувача грошей) слід провести зустрічну перевірку платіжних документів, що зберігаються у справах підприємства, із платіжними документами в банку або у контрагента з операції. Одночасно з'ясовують правильність кореспонденції рахунків і записів у облікових регістрах, так як часом зловживання можуть бути приховані шляхом складання неправильних бухгалтерських проводок, не підтверджених документами, а також сторніровочних записів без документальних підтверджень і без відповідної дійсності потреби або неправильним підрахунком чи перенесенням підсумків з однієї сторінки регістру на іншу.
Обов'язком аудитора є також перевірка правильності та обгрунтованості перерахування коштів за товарно-матеріальні цінності, для чого порівнюють суми, вказані в платіжних документах, з даними виписки банку і записами на рахунку 63 "Розрахунки з постачальниками і підрядниками "або на рахунку 37" Розрахунки з різними дебіторами ». Тут за прибутковими документами перевіряють повноту і правильність оприбуткування товарно-матеріальних цінностей, і якщо є сумніви в справжності документів чи достовірності операцій, слід провести зустрічну перевірку їх у постачальників продукції.
Перевіряючи видаткові банківські документи, необхідно групувати в окремій відомості всі оплачені штрафи, неустойки та інші платежі, пов'язані з порушенням договірних умов, яка дасть можливість потім перевірити повноту відображення їх на відповідних рахунках, і прийняті підприємством заходи щодо відшкодування за рахунок винних осіб сум заподіяної шкоди.
Перевіркою наявності банківських документів встановлюють, чи не допускалося неправильне перерахування авансів і платежів за безоварним рахунками або оплата рахунків інших організацій, які не мають відношення до підприємства, яке перевіряється.
Під час перевірки операцій за розрахунками акредитивами слід звірити залишки сум і обороти за виписками банку із записами в регістрах бухгалтерського обліку. Одночасно з'ясовують причини, які зумовили розрахунки за акредитивною формою, чи передбачена ця форма розрахунків договором або може вона застосовується як санкція з боку постачальників за несвоєчасні платежі. Потім перевіряють повноту і своєчасність використання і повернення невикористаних акредитивів, а також повноту оприбуткування матеріальних цінностей, які надійшли від постачальників.
Операції з лімітованими і нелімітований чековими книжками аналізуються з точки зору їх правильності, характеру і повноти оплати. З'ясовують, чи не проводиться оплата лімітованими чеками видатків, які не включаються до авансові звіти підзвітних осіб як здійснені готівкою.
Після встановлення подібних фактів слід визначити розмір завданого підприємству збитку і винних осіб. Слід також перевірити, чи збігається залишок за книжкою лімітованих чеків, відображений на корінці останнього використаного чека, із залишком на дату перевірки за рахунком 313 "Інші рахунки в банку в національній валюті", а також із залишком за випискою банку. Залишок грошей на кінець місяця по виписці банку деколи не збігається із залишком ліміту за лімітованою книжкою. Це пояснюється тим, що видані з лімітованих книжок чеки не були до кінця місяця пред'явлені одержувачами в банк до оплати.
Об'єктом контролю аудитора можуть бути операції з перерахуваннями грошей з рахунку в банку на рахунку в Ощадбанк, тому що вони можуть бути пов'язані з передачею грошей підставним особам, крадіжками кошти.
Здійснюючи перевірку операцій на рахунку 312 "Поточні рахунки в іноземній валюті ", слід встановити, чи відповідають залишки коштів, відображених у виписці банку, залишку коштів, який значиться по обліку; повноту і достовірність банківських виписок і прикладених до них документів; правильність операцій і достовірність банківських виписок і первинних документів, правильність кореспонденції рахунків за операціями на поточних рахунках в іноземній валюті і записів у облікових регістрах. Особливу увагу звертають на повноту зарахування на транзитні валютні рахунки валютної виручки, яка надійшла на адресу підприємства.
Під час перевірки операцій за поточним рахунком в іноземній валюті слід врахувати, що суб'єкти господарювання можуть здійснювати скупку, обмін, продаж валюти за ліцензією Національного банку України в установленому законом порядку.