Розрахунки з відшкодування завданих збитків ведуться на балансовому рахунку 37 "Розрахунки з різними дебіторами", субрахунку 375 "Розрахунки з відшкодування завданих збитків". Перевіряючи такі розрахунки, аудитор, перш за все, повинен проаналізувати розрахунки по нестачах і крадіжок і встановити, чи дотримано строки та порядок розгляду випадків недоліків і втрат, як забезпечується їх відшкодування. Особливо ретельно треба вивчити факти списання недоліків і втрат на витрати виробництва і на результати діяльності підприємства.
Зокрема, аудитор перевіряє правильність і своєчасність оформлення документів по претензіях про недоліки і крадіжках, перевіряє чи не було випадків повернення судом або арбітражем матеріалів щодо недостач і псування з причини неналежного оформлення матеріалів. Важливо з'ясувати причини виникнення недоліків і псування (поганий стан складських приміщень, порушення правил прийому та відпуску матеріальних цінностей за кількістю та якістю з одного підрозділу (цеху) в інший). Слід також з'ясувати, чи правильно визначена сума збитків (сума збитків розраховується за ринковими цінами даної місцевості). Крім того, аудитор з'ясовує, чи забезпечено на підприємстві відшкодування матеріальних збитків (недоліків, розтрат), організований чи контроль за утриманням заборгованості за виконавчими листами.